거제시민축구단은 대한민국 경상남도 거제시를 연고지로 하는 축구단으로, 2019년 K5리그 부산권역 (참가팀 7팀중 6위)에서 첫 시즌을 보냈다. 리그가 끝나고 한 달도 안 돼서 홈경기장 거제종합운동장을 관리하던 거제시와 운영권 분쟁을 벌였는데, 거제시는 거제시민축구단의 홈경기 사용을 거부하고 취소하는 등의 조치를 취했다. 결국 거제시민축구단은 2020시즌 무대에서 사라졌다. 2022년 거제시 축구계의 관계자들을 중심으로 다시 팀이 구성되어 2023 K5리그 부산권역에 참가하기로 했다.
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